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但“汪辜会谈”也遭到了相当程度的抗议，时任民进党立法委员的施明德等人率领十多名民进党公职人员抗议，表达反对国共片面和谈的立场。图为1993年4月28日，台湾民进党人士在“汪辜会谈”场外以文化衫形式表示抗议。

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真正两岸关系缓解却并没有马上到来，反而在1995年前后陷入一个低谷。1995年6月，李登辉访问美国，此举引发大陆不满，第二次“汪辜会谈”所做的准备中断，两岸关系趋于紧张。图为1995年，一队军车在金门岛巡查。

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1995年到1996年间，大陆方面在台湾海峡进行军事演习，美国紧急调动两个舰艇编队应对，第三次台海危机发生，台海一时间战云密布。图为1996年3月7日，北京军事博物馆外的广告牌前站着一名男子。

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军事演习并没有能够改变李登辉当选“总统”的结果，但双方的直接联系却因此变得不稳定，两岸遗留的各种问题悬而未决。图为1997年6月11日，台湾新竹县，一名保安正在看守大陆非法移民，总共有253名非法入境者持有在该中心等待遣返中国。

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直到1998年10月，辜振甫带团访问北京，两岸才再次恢复协商对话的共识，第二次"汪辜会谈"也重启。图为1998年10月18日，北京，辜振甫接受陈云林的礼物：一幅“相逢一笑泯恩仇”书法作品。

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第二次“汪辜会谈”虽然艰难举行，但周边仍然充满着不稳定因素。图为1998年10月28日，台北国际机场停机坪上停着一架中国国际航空公司的飞机，官员称飞行员因为不满工作环境和工资待遇劫持了飞机。

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2000年，台湾民进党执政，两岸关系持续紧张，第三次“汪辜会谈”一直到2005年两人先后去世也始终未能实现。但随着两岸民间交往的增多，“三通”路逐渐打开。图为2000年4月11日，台湾海峡妈祖岛附近海域，一名大陆渔民和一名台湾渔民进行私下交易。尽管官方禁止，但此海域间渔民的私下交易并不见少。

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2001年6月8日上午11时30分，从台湾高雄直航厦门的“金门快轮”抵达厦门和平码头，这是第一艘从台湾本岛直航大陆的台湾客轮。

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除了“小三通”（金门和马祖与福建沿海实现客运直航）外，2000年，台湾海峡的海底光缆铺设，两岸直达通信路由建成；2003年春节期间，两岸达成包机直航协议，两岸直航仅象征性通过香港。图为2004年6月22日，一名游客在厦门通过望远镜观看对岸的金门岛，他身后的标语上写着“一国两制统一中国”。

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“小三通”开放过后，厦门、金门地区的旅游业也得到了高速发展，不少人会特意来看一些“历史遗迹”。图为2004年3月28日，金门岛附近，一艘旅游船在厦门-金门附近海域行驶。